Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms