Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDRD12Q587J7 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms