Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LETM2Q2VYF4 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms