Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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CCDC96Q2M329 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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CCDC96Q2M329 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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CCDC96Q2M329 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC96Q2M329 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC96Q2M329 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC96Q2M329 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC96Q2M329 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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