Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms