Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RTL8BQ17RB0 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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