Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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VPS72Q15906 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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