Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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