Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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