Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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