Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms