Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms