Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DHRS9-201ENST00000357546 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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