Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK2Q13002 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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