Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms