Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms