Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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