Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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