Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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