Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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