Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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