Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NRG3-204ENST00000404576 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms