Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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