Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFTN1Q14699 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms