Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF2H3Q13889 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms