Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms