Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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TCOF1Q13428 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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