Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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