Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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CHAF1BQ13112 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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CHAF1BQ13112 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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CHAF1BQ13112 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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CHAF1BQ13112 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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