Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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