Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms