Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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