Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CEP290O15078 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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