Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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