Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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