Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3Q9NR81 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms