Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCBE1Q6UXH8 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms