Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MS4A2-201ENST00000278888 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms