Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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COL24A1Q17RW2 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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