Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NRF1Q16656 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms