Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms