Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CBFBQ13951 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CBFBQ13951 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CBFBQ13951 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CBFBQ13951 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CBFBQ13951 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms