Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
MTMR3Q13615 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MTMR3Q13615 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms