Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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