Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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