Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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