Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CHAF1BQ13112 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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