Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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