Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms