Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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TTPAP49638 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TTPAP49638 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TTPAP49638 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TTPAP49638 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TTPAP49638 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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